Primerjava dveh metod izolacije DNK pri mrenah (Barbus Cuvier, 1817)Puškar Šupuk, Vahida (Avtor) Janžekovič, Franc (Mentor) Pipenbaher, Nataša (Komentor) elektroforezaPCR metodacitokroma bmrene.V filogenetskih študijah obstajajo številne metode izolacije DNK iz živalskih celic. Namen diplomskega dela je ugotoviti ustrezno metodo izolacije DNK, ki bi nam služila za nadaljne filogenetske analize. Primerjali smo klasično fenol – kloroform metodo izolacije DNK s komercialnim kompletom QIAamp DNA Mini Kit-om (QIAGEN). Kot model smo vzeli ribe iz rodu mren, Barbus Cuvier.Vzorci mren so bili različne starosti, zato smo jih poimenovali Skupina 1 (izlov 2011.) in Skupina 2 (izlov 2004.). DNK smo izolirali iz dela analne plavuti mren. Z elektroforezo na agaroznem gelu smo ugotavljali kakovost izolirane DNK pri obeh metodah ter med skupinama. S pomočjo Qubit fluorimetra pa smo izmerili koncentracije izoliranih vzorcev DNK. Zaradi nejasnosti, katera metoda izolacije je uspešnejša, smo nadaljeveli analize s PCR metodo, s katero smo pomnožili regijo citokrom b na mtDNK. Sklepali smo, da je za izolacijo genomske DNK bolj primerna metoda s QIAamp DNK Mini Kit-om, vendar pa to ne velja za analize s PCR metodo, metodo pomnoževanja regije citokroma b na mtDNK, kjer je uspešnejša klasična metoda s fenol - kloroformom. Kakovost izolirane DNK je boljša s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN), prav tako je čas izolacije krajši s kompletom. Iz česar lahko zaključimo, da sta obe metodi primerni za izolacijo DNK, vendar je postopek s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN) enostavnejši in hitrejši. [V. Puškar Šupuk]20142014-01-05 22:00:06Diplomsko delo43346sl