In silico načrtovanje potencialnih peptidov, ki preprečujejo agregacijo biofarmacevtskih proteinovRistevska, Emilija (Avtor) Zalar, Matja (Mentor) Bren, Urban (Komentor) in silico načrtovanjeagregacija proteinovantiagregacijski peptidiCamSolAggrescantopnost peptidovV diplomskem delu prikazujemo pristop in silico načrtovanja peptidov, ki bi lahko preprečevali agregacijo biofarmacevtskih proteinov. Namen našega dela je bil analizirati fizikalno-kemijske lastnosti več tisoč kratkih peptidnih sekvenc in oceniti njihov potencial za zaviranje agregacije. Osredotočili smo se na težke in lahke verige (s skupno več kot 7000 sekvenc dolžine 15 aminokislin), kjer smo kvantitativno izračunali vsebnost polarnih, nabitih, hidrofobnih in aromatskih aminokislin ter njihove deleže. Uporabili smo orodji CamSol Intrinsic in Aggrescan, s katerima smo ocenili topnost in agregacijski potencial posameznih zaporedij. Rezultati kažejo, da peptidi z višjo vsebnostjo polarnih in nabitih ostankov dosegajo višje CamSol ocene in nižje NHSA vrednosti, kar nakazuje na boljšo topnost in manjšo nagnjenost k agregaciji. Nasprotno pa je večja vsebnost hidrofobnih in aromatskih aminokislin korelirala z nižjo topnostjo in večjim agregacijskim potencialom. Izvedli smo tudi primerjave med težkimi in lahkimi verigami ter analizirali podobnosti zaporedij in lokalni prispevek posameznih aminokislin k topnosti. Diplomsko delo tako ponuja temelje za nadaljnje načrtovanje funkcionalnih peptidov, ki bi lahko služili kot terapevtska orodja za izboljšanje stabilnosti biofarmacevtskih produktov.[E. Ristevska]20262026-04-08 22:54:32Diplomsko delo/naloga97738sl