Optimizacija zvijanja proteinov znotraj kubične mreže s pomočjo evolucijskega algoritma in grafične procesne enoteVipotnik, Matic (Avtor) Bošković, Borko (Mentor) Brest, Janez (Komentor) zvijanje proteinovCUDAoptimizacijaevolucijski algoritemV diplomskem delu smo implementirali algoritem za optimizacijo zvijanja proteinov znotraj modela HP. Algoritem na centralno procesni enoti porabi veliko časa, da protein zvije v optimalno strukturo. Zato smo algoritem prilagodili, da se izvaja na grafični procesni enoti. Učinkovitost algoritma smo analizirali na znanih sekvencah iz literature. S pomočjo algoritma, ki se je izvajal na grafični procesni enoti smo v povprečju dosegli 10,2 - kratno pohitritev v primerjavi z algoritmom, ki se izvaja na centralno procesni enoti.[M. Vipotnik]20202020-09-16 15:17:04Diplomsko delo/naloga77845UDK: 004.318.021(043.2)COBISS_ID: 35582723NUK URN: URN:SI:UM:DK:ZSNWYAFNsl