20.500.12556/DKUM-65265 Prisotnost različnih genotipov bakterije Clostridium difficile pri hospitaliziranih bolnikih v Sloveniji med dvomesečnim zimskim obdobjem Diversity of C. difficile PCR ribotypes isolated from hospitalised patients in Slovenia during two-winter-month period Izhodišča: Clostridium difficile je trenutno v svetu med najpomembnejšimi povzročitelji bolnišničnih črevesnih okužb. Seve lahko nadalje razlikujemo z ribotipizacijo. Nekateri ribotipi (npr. 027) so v številnih evropskih državah povezani z obširnimi izbruhi, povišano obolevnostjo in povišano smrtnostjo. V tem prispevku opisujemo razširjenost različnih ribotipov na območju celotne Slovenije. Metode: Seve bakterije C. difficile, ki so jih osamili v vseh osmih laboratorijih, kjer v Sloveniji diagnosticirajo bakterijo C. difficile, smo ribotpizirali. Prav tako smo zbrali podatke o skupnem številu opravljenih preiskav na C. difficile ter demografske podatke (starost in spol bolnikov). Rezultati: V dvomesečnem zimskem obdobju je bilo v Sloveniji testiranih skupaj 860 vzorcev, od teh je bilo pozitivnih 154 (17,9 %) vzorcev pri 125 bolnikih. Odstotek pozitivnih vzorcev v posameznem laboratoriju se je gibal od 13,3 do 43,2 %. Dva od osmih laboratorijev (oba iz primorsko-obalne regije) v času študije nista imela pozitivnih vzorcev. Tipiziranih je bilo 149 sevov. Uvrstili smo jih v 35 ribotipov, vendar je bilo več kot polovica sevov (57,7 %) v samo dveh ribotipih, 027 in 014/020. Ribotip 027 v Sloveniji do leta 2010 ni bil zaznan, v tej študiji je bil najpogostejši ribotip, prevladoval pa je v severovzhodni regiji. Zaključki: Raznolikost sevov C. difficile v Sloveniji je velika. Prevladovanje ribotipa 027 in visok odstotek pozitivnih vzorcev v nekaterih regijah kažejo na možnost izbruhov okužbe. Background: Clostridium difficile is an important cause of nosocomial diarrhoea. Strains arefurther differentiated into PCR ribotypes, andsome ribotypes (e.g. 027) are often associated with outbreaks, increased disease severity and increased mortality. Here we describe the diversity of C. difficile among human isolates in Slovenia. Methods: All eight microbiological diagnostic laboratories providing C. difficile diagnostics in Slovenia have participated. Isolates from two month- winter period were collected and ribotyped.The following data were also collected from the laboratories: number of all tested samples, number of all positive samples, and patient age and gender. Results: In a two-month period, altogether 860 samples were tested for C. difficile in all participating laboratories. Of those, 154 (17.9 %) samples from 125 patients were positive. The percentage of positive samples in different laboratories ranged from 13.3 to 43.2%. Two out of eight laboratoriesdid not have positive samples. C. difficile strains(n= 149) were grouped into 35 ribotypes. However, 57.7% of all strains belonged only to two PC Rribotypes (027 and 014/020). PCR ribotype 027 was not present in Slovenia until 2010, but was in this study the most prevalent PCR ribotype and present mainly in the northeast region. Conclusions: There is a substantial diversity of C. difficile ribotypes in Slovenia. A high prevalence of ribotype 027 and a high percentage of positive samples in some laboratories indicate the presence of C. difficile outbreaks. Clostridium difficile bolnišnične okužbe mikrobiološka diagnostika Clostridium difficile nosocomial infections microbiology diagnostics true false true Slovenski jezik Angleški jezik Znanstveno delo 2017-03-27 13:22:07 2017-03-27 13:23:11 2022-07-07 03:09:00 2019-07-11 15:12:50 2013 0 0 str. 739-745 št. 11 Letn. 82 nov. 2013 0000-00-00 Zaloznikova Objavljeno NiDoloceno 0000-00-00 0000-00-00 0000-00-00 1318-0347 616-07 32893696 31093721 1318-0347 URN:SI:UM:DK:SNMVDYQU Zdravniski_vestnik_2013_Rupnik_et_al._Prisotnost_razlicnih_genotipov_bakterije_Clostridium_difficile_pri_hospitaliziranih_bolnikih_v_Slo.pdf Zdravniski_vestnik_2013_Rupnik_et_al._Prisotnost_razlicnih_genotipov_bakterije_Clostridium_difficile_pri_hospitaliziranih_bolnikih_v_Slo.pdf 1 93D943FE7A2D49395B87CCD1B8B17400 91551de5d6b073f96f5ea8e032012ea217f85368bdd9bf33123190437ed54430 060b257f-7c0e-11eb-bb7a-00155d0001ca https://dk.um.si/Dokument.php?lang=slv&id=110205 http://vestnik.szd.si/index.php/ZdravVest/article/view/990 1 https://dk.um.si/Dokument.php?lang=slv&id=110204 Medicinska fakulteta 0 0 0