| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:PORAVNAVA VEČ NUKLEOTIDNIH ALI PROTEINSKIH ZAPOREDIJ
Avtorji:ID Perčič, Uroš (Avtor)
ID Podgorelec, David (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Datoteke:.pdf MAG_Percic_Uros_2013.pdf (1,85 MB)
MD5: AABD74FEA63C86D1A2289CD085A627B0
PID: 20.500.12556/dkum/de7ed40a-8b57-4cc8-8a7a-28eb0b4d0f9d
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:FERI - Fakulteta za elektrotehniko, računalništvo in informatiko
Opis:Hkratna poravnava več DNK ali proteinskih zaporedij je eno najpogostejših opravil na področju bioinformatike. Uporabna je za filogenetsko analizo, detekcijo homologije med sekvenciranim genom in obstoječo družino genov ter za napovedovanje strukture proteinov. Uporaba eksaktnega algoritma je zaradi eksponentne zahtevnosti problema v praksi nemogoča. Namen tega dela je preučitev računalniških hevrističnih algoritmov, ki so se razširili kot alternativa ročni poravnavi več zaporedij. V okviru tega sta bila implementirana in ocenjena dva algoritma, ki sta se že v osnovni različici izkazala za dovolj natančna in učinkovita za uporabo na realnih zaporedjih. V delu so predstavljeni rezultati testiranja algoritmov ter nadaljnje možnosti raziskovanja.
Ključne besede:DNK zaporedje, proteinsko zaporedje, poravnava zaporedij, homologija
Kraj izida:Maribor
Založnik:[U. Perčič]
Leto izida:2013
PID:20.500.12556/DKUM-40633 Novo okno
UDK:575.112:004(043)
COBISS.SI-ID:17058838 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:MXFSXXWW
Datum objave v DKUM:20.06.2013
Število ogledov:2017
Število prenosov:227
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FERI
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:MULTIPLE ALIGNMENT OF NUCLEOTIDE OR PROTEIN SEQUENCES
Opis:The simultaneous alignment of a number of DNA or protein sequences is one of the most common tasks in bioinformatics. It is useful for phylogenetic analysis, detection of homology between a newly sequenced gene and an existing gene family and for prediction of protein structure. The use of an exact algorithm is practically impossible due to the exponential nature of the problem. The goal of this work is to study several heuristic computer algorithms that have emerged as an alternative to manual alignment construction. Two algorithms have been implemented and evaluated. They have been considered effective enough for construction of real-life multiple sequence alignments. Test results are shown and suggestions for further studies are given.
Ključne besede:DNK sequence, protein sequence, sequence alignment, homology


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici