| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:IZOLACIJA BAKTERIJ IZ RODU Clostridium IZ VZORCEV PRSTI
Avtorji:ID Rikanovič, Tanja (Avtor)
ID Rupnik, Maja (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Datoteke:.pdf UNI_Rikanovic_Tanja_2013.pdf (1,29 MB)
MD5: D72F1E8DD7B915512F9BFF4E6759E9C8
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Diplomsko delo
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:Klostridiji so paličaste, obligatno anaerobne, po Gramu pozitivne bakterije, ki tvorijo izjemno odporne spore. Zaradi slednjega so klostridiji ubikvitarni, saj jih lahko najdemo v okoljih kot so prst, okoljske vode, prisotni pa so tudi v človeškem in živalskem prebavilu. Ena izmed pomembnih vrst tega rodu je bakterija Clostridium difficile, ki je trenutno v svetu eden izmed pomembnejših povzročiteljev bolnišničnih okužb. V zadnjem času pa narašča tudi število izvenbolnišničnih okužb. Bolezen povzročajo le toksigeni sevi, ki izdelujejo toksin A in/ali toksin B, ki sta glavna dejavnika virulence C. difficile. V diplomskem delu smo iz 6 različnih vrst/tipov prsti osamili več klostridijskih vrst, tudi C. difficile. Izolate smo identificirali s komercialnim sistemom MALDI Biotyper (Bruker Daltonics), ki je komercialna fenotipska metoda za identifikacijo in temelji na analizi proteinov s pomočjo laserske svetlobe. Izolate C. difficile smo še karakterizirali, in sicer z dvema dobro razširjenima genotipizacijskima metodama: toksinotipizacijo in PCR ribotipizacijo. Skupno smo osamili 34 klostridijskih izolatov, ki so pripadali 7 različnim vrstam. Med njimi so prevladovale vrste Clostridium glycolicum (n=11), Clostridium bifermentans (n=5) in Clostridium mayombei (n=4). C. difficile (n=10) smo zaznali le v vzorcu sedimenta reke Drave, s selektivno gojitveno metodo. Skupno deset izolatov iz tega vzorca je bilo netoksigenih in PCR ribotipa 010. Največje število in raznolikost klostridijev smo določili v vzorcu komposta. Z raziskavo v diplomskem delu smo potrdili, da lahko v različnih okoljih pričakujemo različne predstavnike rodu Clostridium, raznolikost vrst pa je odvisna od tipa okolja nabranih vzorcev. Bakterije C. difficile sicer nismo našli v različnih vzorcih prsti, pač pa v rečnem sedimentu, kjer do sedaj v Sloveniji še ni bil opisan.
Ključne besede:klostridiji, prst, Clostridium difficile, identifikacija, toksinotipizacija, PCR ribotipizacija, raznolikost vrst
Kraj izida:Maribor
Založnik:[T. Rikanović]
Leto izida:2013
PID:20.500.12556/DKUM-42814 Novo okno
UDK:579.852.13(043.2)
COBISS.SI-ID:20168968 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:UVIYBD0R
Datum objave v DKUM:13.11.2013
Število ogledov:3417
Število prenosov:363
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:FNM
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Isolation of bacteria from genus Clostridium from soil samples
Opis:Clostridia are obligatory anaerobic, Gram-positive rods, which form very resistant spores. The latter makes them ubiquitous and could therefore be detected in soil, surface waters, and are also present in human and animal gut. One of the important species from the genus Clostridium is Clostridium difficile, now considered to be one of very important nosocomial pathogen. However, in recent years a significant increase in number of community-acquired C. difficile infections was observed. Disease is caused only by toxigenic strains that produce toxin A and/or toxin B, which are the main C. difficile virulence factors. In Graduation Thesis different Clostridia species, including C. difficile were isolated from 6 different soil samples. Isolates have been identified by commercial MALDI Biotyper system (Bruker Daltonics), which is phenotypic identification method, based on the protein analysis using laser light. Furthermore, C. difficile isolates have been characterized by two widely used genotyping methods: toxinotyping and PCR ribotyping. Altogether 34 clostridia isolates were obtained and belonged to 7 different species, where Clostridium glycolicum (n=11), Clostridium bifermentans (n=5) and Clostridium mayombei (n=4) predominated. C. difficile (n=10) was isolated only from one sample; sediment of river Drava by selective cultivation method. All 10 isolates characterized as non-toxigenic strain of PCR ribotype 010. In compost sample the highest number and strains diversity of isolated clostridia was determined. Within this research, multiple Clostridium species from soil were determined. Diversity and the number depended on the soil type. We didn't find C. difficile in any of the tested soil samples, however, it was detected in the river sediment, where up to now in Slovenia has not yet been described.
Ključne besede:Clostridia, soil, Clostridium difficile, identification, toxinotyping, PCR ribotyping, species diversity


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici