| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Optimizacija produkcije entropije in Shannonove informacijske entropije v encimskih reakcijah
Avtorji:ID Vunjak, Aleš (Avtor)
ID Dobovišek, Andrej (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
Datoteke:.pdf UN_Vunjak_Ales_2016.pdf (979,06 KB)
MD5: 8909BDBACDD52ABE75D80654CF327A71
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Diplomsko delo
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:Odprti reakcijski sistemi med relaksacijo teţijo v neravnovesno stacionarno stanje. Takšni sistemi so v naravi zelo pogosti. Še najbolj znani so biokemijski procesi v bioloških celicah. Za analizo takšnih sistemov se je v zadnjih desetletjih vse bolj uveljavil princip maksimalne produkcije entropije (princip MPE). V tem diplomskem delu s principom MPE raziskujemo encimsko reakcijo kot primer odprtega neravnovesnega sistema v biološki celici. S principom MPE študiramo, ali encimska reakcija v stacionarnem stanju poteka ob pogoju maksimalne produkcije entropije. Optimizacijski postopek produkcije entropije za encimsko reakcijo, ki ga uporabljamo v diplomskem delu, so razvili raziskovalci Oddelka za fiziko na Fakulteti za naravoslovje in matematiko Univerze v Mariboru. Optimizacijski postopek omogoča teoretične napovedi optimalnih kinetičnih konstant encima, izkoristka reakcije, toka reakcije in termodinamske sile reakcije v stanju z maksimalno produkcijo entropije. Teoretične napovedi modela primerjamo z eksperimentalnimi podatki izmerjenimi za encim glukoza izomeraza [25, 26]. Tako preverjamo veljavnost principa MPE na primeru encimske kinetike. Za reakcijo smo izračunali tudi Shannonovo informacijsko entropijo, ki je v stacionarnem stanju prav tako maksimalna. Izračunana maksimalna vrednost Shannonove informacijske entropije v stanju z maksimalno produkcijo entropije morda nakazuje, da princip MPE opisuje statistično najbolj verjetna neravnovesna stacionarna stanja v odprtih reakcijskih sistemih.
Ključne besede:encimska reakcija, maksimalna produkcija entropije, Shannonova informacijska entropija, fizikalno - matematični model, optimizacija, glukoza izomeraza
Kraj izida:Maribor
Založnik:[A. Vunjak]
Leto izida:2016
PID:20.500.12556/DKUM-61044 Novo okno
UDK:536.75(043.2)
COBISS.SI-ID:22543624 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:G6UPZ1VN
Datum objave v DKUM:19.09.2016
Število ogledov:2020
Število prenosov:183
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:FNM
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Optimization of entropy production and Shannon information entropy in enzyme reactions
Opis:Open reaction systems during the relaxation tend to unbalanced steady state. Such systems are very common in nature. Most known are the biochemical processes in biological cells. For the analysis of such systems it was increasingly established principle of maximum entropy production in recent decades (MPE principle). In this diploma thesis we investigated enzymatic reaction as an example of open no equilibrium system in biological cells with the MPE principle. With the MPE principle we study, if enzymatic reaction in the steady state is carried out under the condition of maximum entropy production. The optimization process of entropy production for an enzyme reaction that we are using in our thesis was developed by researchers of the Department of Physics at the Faculty of Natural Sciences and Mathematics of Maribor University. The optimization process allows the theoretical prediction of optimal kinetic constants of the enzyme yield of the reaction, the reaction flow and thermodynamic forces of reaction in a state of maximum entropy production. We are comparing theoretical predictions of the model to the experimental data measured for the enzyme glucose isomerase [25, 26]. In this way we are checking the validity of the MPE principle on the example of enzyme kinetics. For the reaction we also calculated Shannon’s information entropy, which is in a steady state also maximal. Calculated maximum value of the Shannon information entropy in a state of maximum entropy production may indicate that the MPE principle is describing statistically the most likely nonequilibrium stationary states in an open reaction systems.
Ključne besede:enzyme reaction, maximum entropy production, Shannon information entropy, physical - mathematical model, optimization, glucose isomerase


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici