Izolacija in karakterizacija bakterije Clostridium difficile iz rečnih sedimentov

Horvat, Jan

| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Prva stran > Izpis gradiva

Izpis gradiva

Naslov:	Izolacija in karakterizacija bakterije Clostridium difficile iz rečnih sedimentov
Avtorji:	ID Horvat, Jan (Avtor) ID Janežič, Sandra (Mentor) Več o mentorju... ID Kocuvan, Aleksander (Komentor)
Datoteke:	MAG_Horvat_Jan_2020.pdf (1,42 MB) MD5: C94F13E1F78F13C3726FD63B16E6DCCE PID: 20.500.12556/dkum/6b41141a-463d-44bd-8f37-a366edd653d1
Jezik:	Slovenski jezik
Vrsta gradiva:	Magistrsko delo/naloga
Tipologija:	2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:	FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:	Po Gramu pozitivna anaerobna bakterija Clostridioides (Clostridium) difficile je pogosta povzročiteljica bolnišničnih črevesnih okužb. V zadnjih letih se povečuje število okužb v domačem okolju pri populaciji, ki je bila v preteklosti prepoznana po nizkem tveganju za okužbo. Bakterija tvori odporne endospore, ki ji omogočajo preživetje zunaj gostitelja. Okolje predstavlja enega od možnih rezervoarjev C. difficile. Namen naše naloge je bil raziskati pogostnost bakterije C. difficile v rečnem sedimentu. Vzorčeno je bilo na treh lokacijah vzdolž reke Drave v jesenskem in zimskem letnem času. Skupno je bilo nabranih 6 vzorcev v duplikatih, prisotnost spor bakterije C. difficile je bila dokazana na vseh lokacijah in v vseh vzorcih. Iz vseh vzorcev je bilo osamljenih 335 izolatov C. difficile, ki so bili z metodo PCR-ribotipizacije uvrščeni v 26 različnih PCR- ribotipov. Prevladujoča PCR-ribotipa sta bila 001/072 (29,9 %) in 014/020 (15,5 %), ki sta oba toksigena in sta pogosto povzročitelja okužb pri hospitaliziranih bolnikih v bližnji bolnišnici ter v Sloveniji in v svetu nasploh. Skupno je zgolj 8 PCR-ribotipov pripadalo netoksigenim izolatom, kar predstavlja 30,8 % vseh izolatov. Naši rezultati kažejo, da je rečni sediment bogat rezervoar endospor C. difficile in zaradi visokega deleža toksigenih sevov lahko predstavlja vir okužbe z bakterijo C. difficile.
Ključne besede:	Clostridioides difficile, okoljski vzorci, PCR-ribotipizacija, toksinotipizacija
Kraj izida:	Maribor
Založnik:	[J. Horvat]
Leto izida:	2020
PID:	20.500.12556/DKUM-76864
UDK:	579(043.2)
COBISS.SI-ID:	34652419
NUK URN:	URN:SI:UM:DK:TVEZB1GS
Datum objave v DKUM:	29.10.2020
Število ogledov:	2216
Število prenosov:	107
Metapodatki:
Področja:	FNM
:	Kopiraj citat

Skupna ocena:	(0 glasov)
Vaša ocena:	Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:

Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:	CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna

Povezava:	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:	Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:	19.07.2020

Sekundarni jezik

Jezik:	Angleški jezik
Naslov:	Isolation and characterization of clostridium difficile from river sediment
Opis:	Gram-positive anaerobic bacterium Clostridioides (Clostridium) difficile is a common cause of nosocomial intestinal infections. In recent years, the number of community- acquired Clostridium difficile infection has been increasing, in a population that has been identified in the past for its low risk of infection. The bacterium forms resistant endospores that allow it to survive outside the host. The purpose of our task was to investigate the frequency of C. difficile in river sediment. We sampled at three locations along the river Drava in the autumn and winter seasons. A total of 6 samples were collected in duplicates, and the presence of C. difficile spores was demonstrated at all locations and in all samples. From all samples, 335 C. difficile isolates, which were classified into 26 different PCR ribotypes by the PCR-ribotyping method, were determined. The predominant PCR-ribotypes were 001/072 (29.9%) and 014/020 (15.5%), both of which are toxigens and often cause infections in hospitalized patients in a nearby hospital, in Slovenia, as well as in the world in general. In total, only 8 PCR ribotypes belonged to non-toxigenic isolates, representing 30.8% of all isolates. Our results indicate that river sediment is a rich reservoir of C. difficile endospores and, due to the high proportion of toxic strains, may be a source of C. difficile infection.
Ključne besede:	Clostridioides difficile, environmental samples, PCR-ribotyping, toxinotyping

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)

0 - 0 / 0

Ni komentarjev!

Nazaj