Razvoj genetskega testa za določanje genotipov beta kazeina A1A1, A2A2 in A1A2

Kozmos, Martin

| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Prva stran > Izpis gradiva

Izpis gradiva

Naslov:	Razvoj genetskega testa za določanje genotipov beta kazeina A1A1, A2A2 in A1A2
Avtorji:	ID Kozmos, Martin (Avtor) ID Langerholc, Tomaž (Mentor) Več o mentorju... ID Kozmos, Maša (Komentor)
Datoteke:	MAG_Kozmos_Martin_2020.pdf (1,58 MB) MD5: F6C164D964507200F234AE96FD4E88E4 PID: 20.500.12556/dkum/37af6cc5-0215-4ccd-aa0b-905458eb7061
Jezik:	Slovenski jezik
Vrsta gradiva:	Magistrsko delo/naloga
Tipologija:	2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:	FKBV - Fakulteta za kmetijstvo in biosistemske vede
Opis:	Kravje mleko predstavlja pomemben vir potrebnih hranil za človeka, vendar pa mnogim ljudem povzroča zdravstvene težave. Alergija na mlečne proteine in preobčutljivost sta med najbolj razširjenimi prehranskimi težavami, za katere je med drugim odgovoren tudi mlečni protein beta kazein oziroma njegova alelna različica A1. Ena od rešitev je selekcija goveda (Bos taurus) na različico beta kazeina A2, pri katerem naj ne bi bilo tovrstnih težav oziroma naj bi se pojavljale v močno zmanjšanem obsegu. V okviru magistrskega dela je bil razvit zanesljiv ter cenovno in časovno ugoden genetski test za ločevanje alelnih različic beta kazeina pri govedu. Pri razvoju testa so bili načrtovani začetni oligonukleotidi, ki so sposobni zanesljivo ločevati ob alelni različici. Skozi optimizacijo je bil razvit protokol za izolacijo dezoksiribonukleinske kisline iz dlake goveda. Z optimizacijo števila ciklov, temperaturnih območij in trajanja posameznih korakov je bil ustvarjen protokol polimerazne verižne reakcije, ki uspešno in zanesljivo pomnoži le tisto obliko beta kazeina, ki je prisotna v izoliranem vzorcu dezoksiribonukleinske kisline. Pregled dobljenih rezultatov in končno določanje oblike beta kazeina (A1A1, A1A2 ali A2A2) v vzorcu dezoksiribonukleinske kisline sta bila izvedena s pomočjo talilnih krivulj. Zanesljivost testa je bila odvisna predvsem od uspešnosti načrtovanja in sprememb začetnih oligonukleotidov, njihove temperature prileganja in števila ciklov polimerazne verižne reakcije. Ta test manjšim kmetom ponuja cenovno ugodno genetsko testiranje govedi na prisotnost A2-beta kazeina in nadaljnjo selekcijo, zbiranje ter trženje mleka in mlečnih izdelkov višje kakovosti.
Ključne besede:	beta kazein, qPCR, A2-mleko, genetski test
Kraj izida:	Maribor
Leto izida:	2020
PID:	20.500.12556/DKUM-77715
NUK URN:	URN:SI:UM:DK:KSQ1YKEZ
Datum objave v DKUM:	25.09.2020
Število ogledov:	1329
Število prenosov:	61
Metapodatki:
Področja:	FKBV
:	Kopiraj citat

Skupna ocena:	(0 glasov)
Vaša ocena:	Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:

Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:	CC BY-NC-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Nekomercialno-Brez predelav 4.0 Mednarodna

Povezava:	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/deed.sl
Opis:	Najbolj omejujoča licenca Creative Commons. Uporabniki lahko prenesejo in delijo delo v nekomercialne namene in ga ne smejo uporabiti za nobene druge namene.
Začetek licenciranja:	11.09.2020

Sekundarni jezik

Jezik:	Angleški jezik
Naslov:	Genetic Test Development for Determining A1A1, A2A2 and A1A2 Genetic Beta-Casein Variants
Opis:	Cow's milk is a source of essential nutrients for humans, but it causes health problems to many people. Milk protein allergies, as well as lactose intolerance are among the most common dietary problems. Among other less known agents, the milk protein beta-casein, and in particular its allelic version A1, are responsible for the observed allergies. One of the solutions to the problem is the selection of cattle (Bos taurus) with an A2-beta-casein genotype, which milk could eliminate or at least mitigate such adverse health effects. In this master's thesis, a reliable and cost-effective genetic test for the determination of allelic variants of beta-casein in cattle was developed. For this purpose, oligonucleotide primers capable of distinguishing allelic variants were designed. A protocol was successfully optimized to isolate DNA from bovine hair. By optimizing the number of cycles, temperature and the duration of individual steps, a PCR protocol was prepared that successfully and reliably amplified specific allelic forms of beta-casein in isolated DNA. An analysis of the results and final determination of beta-casein allelic variant (A1A1, A1A2, or A2A2) in genomic DNA samples was performed using temperature melting curves obtained from qPCR instrument. The reliability of the assay was primarily dependent on the primer design and proper modifications, annealing temperature, and the PCR cycle number. The newly developed test offers smaller farmers a cost-effective genetic testing of cattle for the presence of A2-beta-casein allelic variants and hence further selection, collection, and marketing of higher quality milk and dairy products.
Ključne besede:	beta-casein, qPCR, A2 Milk, genetic test

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)

0 - 0 / 0

Ni komentarjev!

Nazaj