| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Detection of vkorc1 polymorphism : comparison of polymerase chain reaction/restriction fragment length polymorphism (pcr + rflp) with allele-specific polymerase chain reaction
Avtorji:ID Stangler Herodež, Špela (Avtor)
ID Stankovič, Nastja (Avtor)
ID Zagradišnik, Boris (Avtor)
ID Erjavec Škerget, Alenka (Avtor)
ID Kokalj-Vokač, Nadja (Avtor)
Datoteke:URL http://www.actamedbio.mf.uni-mb.si/05_11id_amb_69_12.pdf
 
.pdf 05.pdf (468,47 KB)
MD5: 1A0FD9965330E6A10F531EF68D18EA59
 
Jezik:Angleški jezik
Vrsta gradiva:Znanstveno delo
Tipologija:1.01 - Izvirni znanstveni članek
Organizacija:MF - Medicinska fakulteta
Opis:Purpose: The VKORC1 polymorphism is an important genetic factor affecting warfarin dose requirement. Patients require different warfarin doses in order to achieve the target therapeutic anticoagulation. The aim of our study was to determine the frequency of single nucleotide polymorphisms (SNP) in the VKORC1gene in the general population, using a simple, rapid, and economical method. Methods: For genotyping, the restriction fragment length polymorphism (RFLP) of polymerase chain reaction (PCR) amplified DNA was used and compared to allele specific polymerase chain reaction. We genotyped 441 DNA samples obtained from the healthy general population in North Eastern Slovenia. Genotypes for the tested group were evaluated to determine whether the population followed the Hardy Weinberg equilibrium. The genotypes and allele frequencies were calculated. Results: The results obtained using the allele specific polymerase chain reaction were consistent with those obtained using the PCR + RFLP method. The G allele frequency (0.62) was higher than the A allele frequency (0.38) in the general population from North Eastern Slovenia. Conclusions: The PCR+RFLP method involved additional manipulation of the PCR products at the expense of analysis time, consumption of reagents and equipment. The allele specific polymerase chain reaction was a simple and rapid method for the detection of SNP in theVKORC1 gene, and is available in any laboratory with the minimum of equipment and reagents required.
Ključne besede:VKORC1, varfarin, PCR, RFLP, alelno specifična verižna reakcija s polimerazo
Status publikacije:Objavljeno
Verzija publikacije:Objavljena publikacija
Datum objave:01.01.2013
Leto izida:2013
Št. strani:str. 47-52
Številčenje:Letn. 6, št. 2
PID:20.500.12556/DKUM-88256 Novo okno
UDK:575
COBISS.SI-ID:4863039 Novo okno
ISSN pri članku:1855-5640
Datum objave v DKUM:12.04.2024
Število ogledov:377
Število prenosov:11
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:Ostalo
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Gradivo je del revije

Naslov:Acta medico-biotechnica : AMB
Založnik:Medicinska fakulteta, Medicinska fakulteta, Univerzitetna založba Univerze v Mariboru
ISSN:1855-5640
COBISS.SI-ID:242526720 Novo okno

Sekundarni jezik

Jezik:Slovenski jezik
Naslov:Ugotavljanje VKORC1 polimorfizma : primerjava metod verižne reakcije s polimerazo/polimorfizma dolžin restrikcijskih fragmentov (PCR + RFLP) z alelno specifično verižno reakcijo s polimerazo
Opis:Namen: VKORC1 polimorfizem je pomemben genetski dejavnik, ki vpliva na zahtevan odmerek varfarina pri bolnikih, ki potrebujejo različne odmerke varfarina za doseganje antikoagulacijskega terapevtskega učinka. Cilj naše raziskave je bil na vzorcu splošne populacije ugotoviti frekvenco enonukleotidnega polimorfizma (SNP) v VKORC1 genu na preprost, hiter in ekonomičen način. Metode: Za genotipizacijo smo uporabili metodo verižne reakcije s polimerazo oz. polimorfizem dolžin restrikcijskih fragmentov (PCR/RFLP), ki smo jo primerjali z metodo alelno specifične verižne reakcije s polimerazo. Genotipizirali smo 441 vzorcev genomske DNA preiskovancev iz severovzhodne Slovenije. Ocenili smo, ali je izbrana skupina v Hardy Weinbergovem ravnovesju, ter izračunali posamezne genotipe in frekvenco alelov. Rezultati: Rezultati, pridobljeni z alelno specifično verižno reakcijo s polimerazo, so se popolnoma ujemali z rezultati, pridobljenimi z metodo PCR/RFLP. Frekvenca alela G (0,62) je višja kot frekvenca alela A (0,38) v testirani skupini iz severovzhodne Slovenije. Zaključek: Izkazalo se je, da PCR/RFLP metoda vključuje dodatne korake na račun časa analize, porabe reagentov in opreme. Na podlagi rezultatov zaključujemo, da alelno specifična verižna reakcija s polimerazo omogoča odkrivanje SNP v VKORC1 genu na bolj enostaven, hitrejši in cenovno bolj sprejemljiv način.
Ključne besede:VKORC1, warfarin, PCR, RFLP, allele–specific polymerase chain reaction


Zbirka

To gradivo je del naslednjih zbirk del:
  1. Acta medico-biotechnica

Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici