| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Študija in optimizacija vezave antikalinov na male molekule : diplomsko delo univerzitetnega študijskega programa I. stopnje
Avtorji:ID Špec, Alja (Avtor)
ID Jukič, Marko (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Bren, Urban (Komentor)
Datoteke:.pdf UN_Spec_Alja_2024.pdf (1,95 MB)
MD5: 557377090C6FCCB8ADD3DEB9AFB14ECE
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Diplomsko delo/naloga
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Opis:V diplomskem delu smo raziskovali optimizacijo vezave anitkalina na majhno molekulo s tehniko molekulskega sidranja in in silico mutageneze. Osredotočili smo se na razumevanje, kako lahko specifične mutacije aminokislin znotraj antikalina vplivajo na njegove interakcije z različnimi ligandi. Pri tem smo s programskim jezikom Python pripravili skripto, ki nam je pomagala pri izvedbi in silico mutageneze aminokislinskih ostankov in oceno vezave med proteinom in ligandom. Rezultati so pokazali potencialno ugodne mutacije, ki bi lahko povečale vezavno afiniteto liganda. Tako smo pokazali enostavni postopek, s katerim lahko optimiziramo vezavo testnih ligandov na antikaline in s tem skrajšamo in vitro postopke oz. efektivneje izvajamo laboratorijsko delo. Ugotovitve diplomske naloge pa prispevajo tudi dragocen vpogled v podrobnosti interakcij ligand-protein, saj lahko vezavno mesto antikalinov omogoči visoko selektivnost za vezavo preučevanih malih molekul.
Ključne besede:in silico mutageneza, antikalini, molekulsko sidranje, lipokalinske strukture, vezavno mesto
Kraj izida:Maribor
Kraj izvedbe:Maribor
Založnik:[A. Špec]
Leto izida:2024
Št. strani:1 spletni vir (1 datoteka PDF (IX, 40 f.))
PID:20.500.12556/DKUM-89262 Novo okno
UDK:575.224.4+577.112.34(043.2)
COBISS.SI-ID:204923651 Novo okno
Datum objave v DKUM:15.07.2024
Število ogledov:277
Število prenosov:91
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:KTFMB - FKKT
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Licence

Licenca:CC BY-ND 4.0, Creative Commons Priznanje avtorstva-Brez predelav 4.0 Mednarodna
Povezava:http://creativecommons.org/licenses/by-nd/4.0/deed.sl
Opis:Licenca Creative Commons Brez predelav dovoljuje uporabnikom ponovno distribucijo dela, vendar ne v spremenjeni obliki. Zahtevana je navedba avtorstva.
Začetek licenciranja:01.07.2024

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Study and optimisation of anticalin binding to small molecules
Opis:In this thesis, we studied the optimisation of the binding of anticalins to small molecules using techniques of molecular docking and in silico mutagenesis. We examined how specific amino acid mutations within anticalins can affect their interactions with different ligands. In doing so, we used the Python programming language to preapare a script that helped us perform in silico mutagenesis of amino-acid residues and evaluate the binding between protein and ligand. The results indicated potentially advantageous mutations that would increase the binding affinity of the ligand. Thus, we demonstrated a simple procedure that can be applied to optimize the binding of test ligands to anticalins and thus shorten in vitro procedures or improve efficiency of laboratory work. The findings of this thesis also provide valuable insight into the details of ligand-protein interactions as the binding site of anticalins can facilitate high selectivity for the binding of investigated small molecules.
Ključne besede:in silico mutagenesis, anticalins, molecular docking, lipocalin scaffolds, binding sites


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici