| | SLO | ENG | Piškotki in zasebnost

Večja pisava | Manjša pisava

Izpis gradiva Pomoč

Naslov:Primerjava dveh metod izolacije DNK pri mrenah (Barbus Cuvier, 1817)
Avtorji:ID Puškar Šupuk, Vahida (Avtor)
ID Janžekovič, Franc (Mentor) Več o mentorju... Novo okno
ID Pipenbaher, Nataša (Komentor)
Datoteke:.pdf UNI_Puskar_Supuk_Vahida_2014.pdf (1,26 MB)
MD5: 17DEFD32FB5B610CDA6CDF9F12309913
 
Jezik:Slovenski jezik
Vrsta gradiva:Diplomsko delo
Tipologija:2.11 - Diplomsko delo
Organizacija:FNM - Fakulteta za naravoslovje in matematiko
Opis:V filogenetskih študijah obstajajo številne metode izolacije DNK iz živalskih celic. Namen diplomskega dela je ugotoviti ustrezno metodo izolacije DNK, ki bi nam služila za nadaljne filogenetske analize. Primerjali smo klasično fenol – kloroform metodo izolacije DNK s komercialnim kompletom QIAamp DNA Mini Kit-om (QIAGEN). Kot model smo vzeli ribe iz rodu mren, Barbus Cuvier.Vzorci mren so bili različne starosti, zato smo jih poimenovali Skupina 1 (izlov 2011.) in Skupina 2 (izlov 2004.). DNK smo izolirali iz dela analne plavuti mren. Z elektroforezo na agaroznem gelu smo ugotavljali kakovost izolirane DNK pri obeh metodah ter med skupinama. S pomočjo Qubit fluorimetra pa smo izmerili koncentracije izoliranih vzorcev DNK. Zaradi nejasnosti, katera metoda izolacije je uspešnejša, smo nadaljeveli analize s PCR metodo, s katero smo pomnožili regijo citokrom b na mtDNK. Sklepali smo, da je za izolacijo genomske DNK bolj primerna metoda s QIAamp DNK Mini Kit-om, vendar pa to ne velja za analize s PCR metodo, metodo pomnoževanja regije citokroma b na mtDNK, kjer je uspešnejša klasična metoda s fenol - kloroformom. Kakovost izolirane DNK je boljša s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN), prav tako je čas izolacije krajši s kompletom. Iz česar lahko zaključimo, da sta obe metodi primerni za izolacijo DNK, vendar je postopek s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN) enostavnejši in hitrejši.
Ključne besede:elektroforeza, PCR metoda, citokroma b, mrene.
Kraj izida:Maribor
Založnik:[V. Puškar Šupuk]
Leto izida:2014
PID:20.500.12556/DKUM-43346 Novo okno
UDK:577.2(043.2)
COBISS.SI-ID:20290568 Novo okno
NUK URN:URN:SI:UM:DK:LLHLSQ9I
Datum objave v DKUM:28.01.2014
Število ogledov:2816
Število prenosov:174
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
Področja:FNM
:
Kopiraj citat
  
Skupna ocena:(0 glasov)
Vaša ocena:Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom.
Objavi na:Bookmark and Share



Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše podrobnosti ali sproži prenos.

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Comparison of DNA isolation methods om barbels (Barbus Cuvier, 1817)
Opis:Phylogenetic studies may be performed on a wide range of DNA isolation methods. The main purpose of this graduation thesis was to determine the best DNA isolation method for possible phylogenetic analysis. The well - established phenol-chloroform method was compared to the QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN). Barbels, subgenus Barbus Cuvier, were the fish chosen for this comparison. The samples were divided into Group 1 (harvest in 2011) and Group 2 (harvest in 2004) to separate them according to their age. The DNA was isolated from a small portion of the anal fin. The quality of the isolated DNA was always checked with the electrophoresis on horizontal agarose gel. The concentration of the isolated DNA was then measured with Qubit fluorometer. In order to gather more data in favour of one method we have proceded with the amplification of the cytochrome b, one of the mtDNA genes, by using the PCR method. We have concluded that the QIAamp DNA Mini Kit is more suitable for the isolation of the genomic DNA, but the phenol-chloroform method proves to be better when it comes to amplification of cytochrome b. The advantages of the QIAamp Mini Kit are faster isolation and high quality of the isolated DNA. We have thus proven that both methods are suitable for DNA isolation, but the work is faster and simpler with QIAamp DNA Mini Kit.
Ključne besede:electrophoresis, PCR, cytochrome b, barbels.


Komentarji

Dodaj komentar

Za komentiranje se morate prijaviti.

Komentarji (0)
0 - 0 / 0
 
Ni komentarjev!

Nazaj
Logotipi partnerjev Univerza v Mariboru Univerza v Ljubljani Univerza na Primorskem Univerza v Novi Gorici