| Title: | Primerjava dveh metod izolacije DNK pri mrenah (Barbus Cuvier, 1817) |
|---|
| Authors: | ID Puškar Šupuk, Vahida (Author)
ID Janžekovič, Franc (Mentor) More about this mentor... 
ID Pipenbaher, Nataša (Comentor) |
|---|
| Files: |  UNI_Puskar_Supuk_Vahida_2014.pdf (1,26 MB)
MD5: 17DEFD32FB5B610CDA6CDF9F12309913
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Undergraduate thesis |
|---|
| Typology: | 2.11 - Undergraduate Thesis |
|---|
| Organization: | FNM - Faculty of Natural Sciences and Mathematics
|
|---|
| Abstract: | V filogenetskih študijah obstajajo številne metode izolacije DNK iz živalskih celic. Namen diplomskega dela je ugotoviti ustrezno metodo izolacije DNK, ki bi nam služila za nadaljne filogenetske analize. Primerjali smo klasično fenol – kloroform metodo izolacije DNK s komercialnim kompletom QIAamp DNA Mini Kit-om (QIAGEN). Kot model smo vzeli ribe iz rodu mren, Barbus Cuvier.Vzorci mren so bili različne starosti, zato smo jih poimenovali Skupina 1 (izlov 2011.) in Skupina 2 (izlov 2004.). DNK smo izolirali iz dela analne plavuti mren. Z elektroforezo na agaroznem gelu smo ugotavljali kakovost izolirane DNK pri obeh metodah ter med skupinama. S pomočjo Qubit fluorimetra pa smo izmerili koncentracije izoliranih vzorcev DNK. Zaradi nejasnosti, katera metoda izolacije je uspešnejša, smo nadaljeveli analize s PCR metodo, s katero smo pomnožili regijo citokrom b na mtDNK. Sklepali smo, da je za izolacijo genomske DNK bolj primerna metoda s QIAamp DNK Mini Kit-om, vendar pa to ne velja za analize s PCR metodo, metodo pomnoževanja regije citokroma b na mtDNK, kjer je uspešnejša klasična metoda s fenol - kloroformom. Kakovost izolirane DNK je boljša s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN), prav tako je čas izolacije krajši s kompletom. Iz česar lahko zaključimo, da sta obe metodi primerni za izolacijo DNK, vendar je postopek s kompletom QIAamp DNA Mini Kitom (QIAGEN) enostavnejši in hitrejši. |
|---|
| Keywords: | elektroforeza, PCR metoda, citokroma b, mrene. |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [V. Puškar Šupuk] |
|---|
| Year of publishing: | 2014 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-43346 |
|---|
| UDC: | 577.2(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 20290568 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:LLHLSQ9I |
|---|
| Publication date in DKUM: | 28.01.2014 |
|---|
| Views: | 2814 |
|---|
| Downloads: | 174 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | FNM
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
