| Title: | Izolacija in karakterizacija bakterije Clostridum difficile s površine krompirja |
|---|
| Authors: | ID Simonič, Tamara (Author)
ID Rupnik, Maja (Mentor) More about this mentor... 
ID Janežič, Sandra (Comentor) |
|---|
| Files: |  MAG_Simonic_Tamara_2018.pdf (1,06 MB)
MD5: 9DDA165FFAE9DB1039026A9F2CCD086A
PID: 20.500.12556/dkum/3688b65e-6674-4fa2-8c39-bb886c49ca3c
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Master's thesis/paper |
|---|
| Organization: | FKBV - Faculty of Agriculture and Life Sciences
|
|---|
| Abstract: | Clostridium difficile je po Gramu pozitivna, anaerobna, sporogena bakterija, ki povzroča črevesne okužbe, najpogosteje po zdravljenju z antibiotiki, kemoterapiji in po kirurških posegih, ki privedejo do porušenja normalne črevesne mikrobiote. Bakterijo lahko najdemo v različnih naravnih okoljih, črevesju živali in tudi hrani. Namen magistrskega dela je bil izolirati in karakterizirati bakterijo C. difficile s površine krompirjev, kupljenih v različnih lokalnih trgovinah ter iz čim več različnih držav. Iz 8 različnih trgovin smo pridobili 23 vzorcev krompirja, ki so izvirali iz 10 različnih držav. Prisotnost C. difficile smo dokazali pri 14 vzorcih (60,9 %). Iz vseh vzorcev smo osamili 162 izolatov C. difficile, katerim smo najprej s PCR-pomnoževanjem potrdili za C. difficile specifični gen cdd3, ter jih opredelili s PCR-ribotipizacijo in toksinotipizacijo. Vseh 162 izolatov smo uvrstili v 9 različnih PCR-ribotipov: 012, 014/020, 023, 027, 053, 126, 150, SLO 129 in SLO187. Najpogostejši PCR-ribotip je bil 014/020, sledila sta ribotipa 053 in 126. Toksigenih je bilo 137 izolatov, kasneje uvrščenih v 5 različnih toksinotipov – toksinotip 0, I, III, IV in V, 26 izolatov pa je bilo netoksigenih (s PCR nismo mogli dokazati prisotnosti toksinskih genov). Naši rezultati kažejo, da je krompir kontaminiran s sporami bakterije C. difficile v visokem deležu in da lahko na krompirju najdemo enake PCR-ribotipe, kot se pojavljajo pri ljudeh, živalih in v okolju. |
|---|
| Keywords: | Clostridium difficile, krompir, PCR-ribotipizacija, toksinotipizacija |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Year of publishing: | 2018 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-72035 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:924WXSI4 |
|---|
| Publication date in DKUM: | 27.09.2018 |
|---|
| Views: | 2406 |
|---|
| Downloads: | 150 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | FKBV
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
