| Title: | Maksimalna produkcija entropije in maksimalna shannonova informacijska entropija v encimski kinetiki |
|---|
| Authors: | ID Šterk, Marko (Author)
ID Dobovišek, Andrej (Mentor) More about this mentor... 
ID Markovič, Rene (Comentor) |
|---|
| Files: |  MAG_Sterk_Marko_2018.pdf (773,67 KB)
MD5: 1683EA9F922C6931E96FB30308A473BC
PID: 20.500.12556/dkum/fae737f0-74dc-469e-923d-f91d8ab050e6
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Master's thesis/paper |
|---|
| Typology: | 2.09 - Master's Thesis |
|---|
| Organization: | FNM - Faculty of Natural Sciences and Mathematics
|
|---|
| Abstract: | Princip maksimalne produkcije entropije je osrednji optimizacijski princip neravnovesne termodinamike. Princip je dobro raziskan in uveljavljen v sistemih, kjer je zveza med silami in tokovi linearna. Za sisteme, kjer je ta zveza nelinearna pa princip še ni povsem uveljavljen. Primer sistema, kjer je zveza med silami in tokovi nelinearna, so encimske reakcije. V tem magistrskem delu z uporabo principa maksimalne produkcije entropije analiziramo encimsko reakcijo, ki jo poganja encim trioza-fosfat izomeraza, ki je pomemben člen v procesu glikolize in s tem pri proizvodnji energije v večini organizmov. Encim poganja reverzibilno reakcijo v kateri pretvarja substrat dihidroksi acetonfosfat v gliceraldehid-3-fosfat preko vmesnega člena iz skupine enediolov. Z upoštevanjem zakona o ohranitvi mase sistema, ohranitvi encima in fiksne ravnovesne konstante reakcije pokažemo, da v neravnovesnem stacionarnem stanju sistema obstaja maksimum produkcije entropije v odvisnosti od poljubno izbrane kinetične konstante encima. Pokazano je tudi, da v stanju z maksimalno produkcijo entropije soobstajata maksimuma Shannonove informacijske entropije in kinetične fleksibilnosti, kar pomeni, da je stanje z maksimalno produkcijo entropije hkrati tudi najverjetnejše stacionarno stanje, v katerem je encim najfleksibilnejši. Tako napovedane optimalne kinetične konstante encima trioza-fosfat izomeraza primerjamo z eksperimentalno določenimi vrednostmi iz literature in s teoretičnimi napovedmi, ki so jih podali drugi raziskovalci z uporabo svojih optimizacijskih metod. |
|---|
| Keywords: | trioza-fosfat izomeraza, encimska kinetika, produkcija entropije, informacijska entropija, kinetična fleksibilnost |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [M. Šterk] |
|---|
| Year of publishing: | 2018 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-72042 |
|---|
| UDC: | 536.75(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 24106504 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:QMQNYB2M |
|---|
| Publication date in DKUM: | 04.02.2021 |
|---|
| Views: | 1479 |
|---|
| Downloads: | 79 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | FNM
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
