| Title: | Vpliv mikrovalov na zvijanje e2 -peptida: računalniški pristop |
|---|
| Authors: | ID Kocbek, Simon (Author)
ID Bren, Urban (Mentor) More about this mentor...  |
|---|
| Files: |  UN_Kocbek_Simon_2018.pdf (6,69 MB)
MD5: 56090DF6936F8FB506157E176F009BF8
PID: 20.500.12556/dkum/c52b6874-2f17-48ff-8fff-0d019ef47345
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Bachelor thesis/paper |
|---|
| Typology: | 2.11 - Undergraduate Thesis |
|---|
| Organization: | FKKT - Faculty of Chemistry and Chemical Engineering
|
|---|
| Abstract: | Tehnologija je iz dneva v dan bolj integrirana v naše življenje. Hiter razvoj nam je prinesel veliko naprav, ki nam olajšujejo vsakodnevno življene. Veliko število teh komunikacijskih, navigacijskih in skpektroskopskuh naprav pri delovanju izseva mikrovalove. Zaradi visoke izpostavljenosti mikrovalovom je pomembno, da preučimo morebitne negativne vplive te tehnologije. V ta namen smo se odločili, da raziščemo vpliv mikrovalov na gardnike neših teles - peptide. Ubrali smo računalniški pristop in s pomočjo molekulske dinamike preučevali vpliv mikrovalov na zvijanje betapeptida. Z uporabo razklopljnenih termostatov smo ločeno nastavljali rotacijsko, translacijsko in vibracijsko temperaturo sistema betapeptida v raztopini. Primerjali smo zvijanje peptida pod pogoji klasičnega in mikrovalovnega segrevanja in prišli do zaključka, da rotacijsko gibanje polarnega metanola prekine vodikove vezi med topilom in peptidom, kar vodi do tvorbe novih vodikovih vezi med atomi vijačnice. Posledica tega je kompaktnjše zvitje betapeptida. Prav taki strnjeni agregati lahko vodijo do nastanka amiloidnih nitk, ki so povezane z nevrodegenerativnimi boloznimi, kot je Alzheimerjeva bolezen. |
|---|
| Keywords: | Mikrovalovi, simulacije molekulske dinamike, betapeptid, zvijanje |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [S. Kocbek] |
|---|
| Year of publishing: | 2018 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-72070 |
|---|
| UDC: | 54-732(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 21968662 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:PKBZSIFL |
|---|
| Publication date in DKUM: | 05.10.2018 |
|---|
| Views: | 1814 |
|---|
| Downloads: | 134 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | KTFMB - FKKT
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
