| Naslov: | Iskanje mesta začetka podvajanja ter vezavnih mest proteina dnaa pri izbranih probiotičnih bakterijah z uporabo algoritmov |
|---|
| Avtorji: | ID Anžel, Larisa (Avtor) ID Mongus, Domen (Mentor) Več o mentorju...  ID Fijan, Sabina (Komentor) |
| Datoteke: | MAG_Anzel_Larisa_2021.pdf (1,10 MB) MD5: 743A644F6221AEF530D6E1BE58E920A6 PID: 20.500.12556/dkum/cb5b8d66-2b5d-49ec-b540-640e8db89159
|
|---|
| Jezik: | Slovenski jezik |
|---|
| Vrsta gradiva: | Magistrsko delo/naloga |
|---|
| Tipologija: | 2.09 - Magistrsko delo |
|---|
| Organizacija: | FZV - Fakulteta za zdravstvene vede
|
|---|
| Opis: | Uvod: Človeško telo je naseljeno s številnimi bakterijami, arhejami, virusi in enoceličnimi evkariotskimi organizmi, ki na različne načine vplivajo na naše zdravje. Probiotične bakterije so tiste, ki v zadostnih količinah pozitivno vplivajo na zdravje gostitelja. Slednje se morajo razmnoževati, da so pozitivni učinki vidni. Bakterije se razmnožujejo s procesom podvajanja, pri čemer je v začetnih fazah vključeno podvajanje DNK.
Metode: S pomočjo grafa odklona števila gvaninov in citozinov (GC), ki ga pridobimo iz DNK zaporedja, smo ocenili položaj mesta začetka podvajanja za vsak izbran bakterijski sev. V okolici mesta začetka podvajanja se nahajajo posebna zaporedja, na katera se vežejo DnaA proteini. Z iskanjem najpogostejših motivov v okolici nukleotida z najnižjo vrednostjo na grafu GC smo pridobili možno sekvenco vezavnih mest DnaA, kar omogoča vpogled v sekvenco, ki igra pomembno vlogo pri podvajanju bakterijske DNK.
Rezultati: Konsenzna sekvenca vseh izbranih bakterijskih sevov je 5'-TTATCCACA-3', kar sovpada s podatki iz literature, kjer je sekvenca DnaA škatle opredeljena kot 5’-TT(A/T)TNCACA-3'.
Razprava in sklep: Izbrane metode se lahko uporablja za določevanje približnega mesta začetka replikacije, vendar so za dokazovanje le-tega potrebni še dodatni laboratorijski poizkusi. |
|---|
| Ključne besede: | probiotične bakterije, mesto začetka replikacije, GC odkon, najpogostejši motivi |
|---|
| Kraj izida: | Maribor |
|---|
| Založnik: | [L. Anžel] |
|---|
| Leto izida: | 2021 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-79942  |
|---|
| UDK: | 613.292:579.24:575.112(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 77390595  |
|---|
| Datum objave v DKUM: | 23.09.2021 |
|---|
| Število ogledov: | 998 |
|---|
| Število prenosov: | 80 |
|---|
| Metapodatki: |  |
|---|
| Področja: | FZV
|
|---|
|
:
|
Kopiraj citat |
|---|
| | | | Skupna ocena: | (0 glasov) |
|---|
| Vaša ocena: | Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom. |
|---|
| Objavi na: |  |
|---|
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše
podrobnosti ali sproži prenos. |