| Title: | Iskanje mesta začetka podvajanja ter vezavnih mest proteina dnaa pri izbranih probiotičnih bakterijah z uporabo algoritmov |
|---|
| Authors: | ID Anžel, Larisa (Author)
ID Mongus, Domen (Mentor) More about this mentor... 
ID Fijan, Sabina (Comentor) |
|---|
| Files: |  MAG_Anzel_Larisa_2021.pdf (1,10 MB)
MD5: 743A644F6221AEF530D6E1BE58E920A6
PID: 20.500.12556/dkum/cb5b8d66-2b5d-49ec-b540-640e8db89159
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Master's thesis/paper |
|---|
| Typology: | 2.09 - Master's Thesis |
|---|
| Organization: | FZV - Faculty of Health Sciences
|
|---|
| Abstract: | Uvod: Človeško telo je naseljeno s številnimi bakterijami, arhejami, virusi in enoceličnimi evkariotskimi organizmi, ki na različne načine vplivajo na naše zdravje. Probiotične bakterije so tiste, ki v zadostnih količinah pozitivno vplivajo na zdravje gostitelja. Slednje se morajo razmnoževati, da so pozitivni učinki vidni. Bakterije se razmnožujejo s procesom podvajanja, pri čemer je v začetnih fazah vključeno podvajanje DNK.
Metode: S pomočjo grafa odklona števila gvaninov in citozinov (GC), ki ga pridobimo iz DNK zaporedja, smo ocenili položaj mesta začetka podvajanja za vsak izbran bakterijski sev. V okolici mesta začetka podvajanja se nahajajo posebna zaporedja, na katera se vežejo DnaA proteini. Z iskanjem najpogostejših motivov v okolici nukleotida z najnižjo vrednostjo na grafu GC smo pridobili možno sekvenco vezavnih mest DnaA, kar omogoča vpogled v sekvenco, ki igra pomembno vlogo pri podvajanju bakterijske DNK.
Rezultati: Konsenzna sekvenca vseh izbranih bakterijskih sevov je 5'-TTATCCACA-3', kar sovpada s podatki iz literature, kjer je sekvenca DnaA škatle opredeljena kot 5’-TT(A/T)TNCACA-3'.
Razprava in sklep: Izbrane metode se lahko uporablja za določevanje približnega mesta začetka replikacije, vendar so za dokazovanje le-tega potrebni še dodatni laboratorijski poizkusi. |
|---|
| Keywords: | probiotične bakterije, mesto začetka replikacije, GC odkon, najpogostejši motivi |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [L. Anžel] |
|---|
| Year of publishing: | 2021 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-79942 |
|---|
| UDC: | 613.292:579.24:575.112(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 77390595 |
|---|
| Publication date in DKUM: | 23.09.2021 |
|---|
| Views: | 1001 |
|---|
| Downloads: | 80 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | FZV
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
