| Title: | Opredelitev pristopa za kontinuirano sledenje raznolikosti genotipov proti meticilinu odpornega Staphylococcus aureus iz humanih vzorcev |
|---|
| Authors: | ID Žohar Čretnik, Tjaša (Author)
ID Rupnik, Maja (Mentor) More about this mentor...  |
|---|
| Files: |  DOK_Zohar_Cretnik_Tjasa_2024.pdf (4,46 MB)
MD5: 2491287C50B67DF64CF75EAD246E0930
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Dissertation |
|---|
| Typology: | 2.08 - Doctoral Dissertation |
|---|
| Organization: | MF - Faculty of Medicine
|
|---|
| Abstract: | V svetu sistemi sledenja proti meticilinu odpornega Staphylococcus aureus (MRSA) temeljijo predvsem na izolatih iz hemokultur. Omejitve takšnega pristopa so znane.
Z raziskavo, v katero smo vključili MRSA izolate iz dobro opredeljene zbirke izolatov iz različnih kužnin iz obdobja petih let iz tretje slovenske regije, smo identificirali skupino, ki bi bila optimalna za sledenje genetskih lastnosti populacije MRSA.
S sekvenciranjem celotnega genoma in določanjem občutljivosti za protimikrobna zdravila smo analizirali 306 izolatov in pridobili za Slovenijo prve tovrstne podatke.
Ugotovili smo veliko genetsko pestrost izolatov in potrdili 30 MLST sekvenčnih tipov, 39 MLST-SCCmec genetskih linij, 49 spa tipov, 29 fenotipskih rezistenčnih profilov, 57 rezistenčnih in 96 virulenčnih genov.
S pomočjo izolatov iz hemokultur smo sicer zajeli prevladujoče klone, vendar v tej skupini nismo zaznali večine prisotnih klonov in tudi ne nekaterih pomembnih rezistenčnih in virulenčnih genov. Med izolati iz hemokultur je bilo prisotnih 21,3 % spa tipov, 24, 1 % fenotipskih rezistenčnih profilov in 28,2 % MLST-SCCmec genetskih linij, med izolati iz mehkih tkiv pa 65,3 % spa tipov, 58,6 % fenotipskih rezistenčnih profilov, 71,8 % MLST-SCCmec tipov, 100 % virulenčnih genov in 82,5 % rezistenčnih genov, zaradi česar je to skupino izolatov smiselno vključiti v sistem sledenja. |
|---|
| Keywords: | MRSA, klonalna sruktura, sledenje, virulenca, rezistenca |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | T. Žohar Čretnik] |
|---|
| Year of publishing: | 2024 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-88772 |
|---|
| UDC: | 616.98:579.861(043.3) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 218269443 |
|---|
| Publication date in DKUM: | 10.12.2024 |
|---|
| Views: | 323 |
|---|
| Downloads: | 61 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | MF
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
