| Naslov: | Molekulska dinamika vezave cianidina na SIRT6: pomembnost za človeško zdravje : diplomsko delo univerzitetnega študijskega programa I. stopnje |
|---|
| Avtorji: | ID Dimnik, Gašper (Avtor)
ID Bren, Urban (Mentor) Več o mentorju... 
ID Lešnik, Samo (Komentor) |
|---|
| Datoteke: |  UN_Dimnik_Gasper_2025.pdf (3,80 MB)
MD5: 2ED6B5B0EC46FA0A597C441D8CE16A28
|
|---|
| Jezik: | Slovenski jezik |
|---|
| Vrsta gradiva: | Diplomsko delo/naloga |
|---|
| Tipologija: | 2.11 - Diplomsko delo |
|---|
| Organizacija: | FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
|
|---|
| Opis: | Z namenom, ne le podaljšati življensko dobo, temveč tudi ohraniti daljše obdobje zdravja človeka, je vedno več raziskav usmerjenih v razvoj naravnih modulatorjev encimske aktivnosti človeškega sirtuina 6 (SIRT6). Ta namreč sodeluje pri več celičnih procesih, povezanih s staranjem, ki bi jih lahko regulirali s pomočjo naravnih modulatorjev, flavonoidov. Med slednje spadata cianidin ter njegov glukozid cianidin-3-O-glukozid (Cy3G). S pomočjo računalniških orodij smo simulirali molekulske dinamike (MD) vezave teh ligandov na kompleks SIRT6 in adenozin difosfat(ADP)-riboze. Z analizo vrednosti RMSD ter časovnega deleža vodikovih vezi simulacije MD smo preučili stabilnost obeh ligandov v kompleksih ter določili stabilnejšega izmed obeh. Izkazalo se je, da se oba liganda stabilizirata v proteinskih kompleksih po 50 ns simulacije MD, a je ta stabilizacija pri cianidinu močnejša. Analiza vrednosti RMSD za izključno liganda je prav tako pokazala, da je cianidin stabilnejši izmed obeh. Dokončno potrditev tega smo dokazali z analizo vodikovih vezi med ligandoma ter SIRT6. Ugotovili smo, da se pri Cy3G karakteristične vodikove vezi vzpostavijo po 20 ns simulacije MD oziroma po zvišanju vrednosti RMSD. To poveča razliko med eksperimentalno določeno prvotno strukturo ter končno strukturo proteinskega kompleksa SIRT6–Cy3G. To dokazuje, da je cianidin boljša izbira za razvoj selektivnih in učinkovitih modulatorjev SIRT6, a je zaradi razlik v farmakokinetiki smotrno preučiti oba liganda. Te ugotovitve bi lahko vodile v raziskovanje in razvoj terapevtskih učinkovin za zdravljenje bolezni staranja, kot je na primer rak. |
|---|
| Ključne besede: | bolezni staranja, SIRT6, molekulska dinamika, naravni modulatorji encimov, cianidin, cianidin-3-O-glukozid |
|---|
| Kraj izida: | Maribor |
|---|
| Kraj izvedbe: | Maribor |
|---|
| Založnik: | [G. Dimnik] |
|---|
| Leto izida: | 2025 |
|---|
| Št. strani: | 1 spletni vir (1 datoteka PDF (X, 32 f.)) |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-94603 |
|---|
| UDK: | 577.151(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 250796291 |
|---|
| Datum objave v DKUM: | 18.09.2025 |
|---|
| Število ogledov: | 174 |
|---|
| Število prenosov: | 57 |
|---|
| Metapodatki: |    |
|---|
| Področja: | KTFMB - FKKT
|
|---|
|
:
|
Kopiraj citat |
|---|
| | | | Skupna ocena: | (0 glasov) |
|---|
| Vaša ocena: | Ocenjevanje je dovoljeno samo prijavljenim uporabnikom. |
|---|
| Objavi na: |  |
|---|
Postavite miškin kazalec na naslov za izpis povzetka. Klik na naslov izpiše
podrobnosti ali sproži prenos. |
