| Title: | Inhibicija samo-replikacije proteinskih fibrilov |
|---|
| Authors: | ID Curk, Samo (Author)
ID Gosak, Marko (Mentor) More about this mentor... 
ID Šarić, Anđela (Comentor) |
|---|
| Files: |  MAG_Curk_Samo_2018.pdf (10,23 MB)
MD5: 170CFAC6FDD65D387BCBA7547A28D181
PID: 20.500.12556/dkum/51caf013-b6cf-4dea-a484-79039d4ef842
|
|---|
| Language: | Slovenian |
|---|
| Work type: | Master's thesis/paper |
|---|
| Typology: | 2.09 - Master's Thesis |
|---|
| Organization: | FNM - Faculty of Natural Sciences and Mathematics
|
|---|
| Abstract: | Proteinski fibrili nastanejo z agregacijo delno zvitih proteinov in so odgovorni ali pomembno vplivajo na mnogo hudih človeških bolezni, kot sta Alzeimerjeva ali diabetes tipa II. Samo-replikacija fibrilov je proces, v katerem obstoječi proteinski fibrili katalizirajo nastanek novih fibrilov na način, da ponudijo vezavno površino, kjer se proteini lažje srečajo in agregirajo. To prispeva k naglem in eksponentnem napredovanju bolezni. V magistrski nalogi predstavimo Monte Carlo simulacije računalniškega modela agregacije, v katerega vpeljemo inhibitorje. To so delci, ki se lahko vežejo na površino fibrilov in tako inhibirajo oziroma upočasnijo proces samo-replikacije. Takšen način inhibicije se izkaže za zelo učinkovit, ampak zaradi odbojne interakcije med delci naletimo tudi na pojav makromolekularnega gnečenja, ki povzroči, da se pri določeni pokritosti površine s proteini hitrost samo-replikacije poveča. Edinstven deskriptor hitrosti replikacije najdemo v povprečni velikosti skupka na površino vezanih proteinov, ki nosi informacijo o celotni porazdelitvi agregacijskih skupkov. Predstavimo teorije, ki uspešno razložijo vse značilnosti opažanega obnašanja. S pomočjo mrežnega modela napovemo, katere interakcije med delci na površini imajo največji inhibicijski potencial. |
|---|
| Keywords: | agregacija amiloidov, samo-sestavljanje proteinov, inhibicija, ra\v cunalni\v ske simulacije, metoda Monte Carlo, nukleacijski mehanizem, gne\v cenje makromolekul, krajina proste energije, statisti\v cna mehanika, mehka snov, fizikalna kemija |
|---|
| Place of publishing: | Maribor |
|---|
| Publisher: | [S. Curk] |
|---|
| Year of publishing: | 2018 |
|---|
| PID: | 20.500.12556/DKUM-72364 |
|---|
| UDC: | 577.3(043.2) |
|---|
| COBISS.SI-ID: | 24130568 |
|---|
| NUK URN: | URN:SI:UM:DK:KAMTFQ19 |
|---|
| Publication date in DKUM: | 20.11.2018 |
|---|
| Views: | 1314 |
|---|
| Downloads: | 170 |
|---|
| Metadata: |    |
|---|
| Categories: | FNM
|
|---|
|
:
|
Copy citation |
|---|
| | | | Average score: | (0 votes) |
|---|
| Your score: | Voting is allowed only for logged in users. |
|---|
| Share: |  |
|---|
Hover the mouse pointer over a document title to show the abstract or click
on the title to get all document metadata. |
