Statistics of DKUM

Bibliography of the person, including all types of documents, not only theses.

PhD theses (5)

1. Sebastjan Kralj: Razvoj in uporaba metod računalniške kemije pri načrtovanju terapevtskih sredstev proti COVID-19
2. Matic Broz: Preučevanje sekundarne strukture proteinov z računalniškimi simulacijami molekularne dinamike in nevronskimi mrežami
3. Anja Petek: Vpliv ß-ciklodekstrina na kinetiko in mehanizem reakcije umiljenja etilacetata
4. Veronika Furlan: Preučevanje mehanizmov antikarcinogenega in nevroprotektivnega delovanja naravnih polifenolnih spojin
5. Martin Rozman: Uporaba inverzne geometrijske konfiguracije za razvoj senzorskih in elektrokromnih trakov

MSc theses (20)

1. Katja Fingušt: Preučevanje antioksidativne aktivnosti polifenola arzanola s pomočjo kvantno-mehanskih izračunov
2. Amanda Žižek: Preučevanje mehanizma inhibicije rožmarinske kisline na glavni proteazi sars-cov-2 z dinamičnimi simulacijami
3. Tamara Galun: CMC kationskih površinsko aktivnih snovi v vodni raztopini kohumulona
4. Maj Virant: Application of Virtual Reality in Chemistry and Chemical Engineering
5. Adela Avdičević: Uporaba modernih računalniških pristopov za iskanje novih protivirusnih zdravil
6. Katja Gole: Primerjava proteomov glavnih predstavnikov virusov iz družine Filoviridae in identifikacija potencialnih vezavnih mest za načrtovanje ligandov
7. Miha Fermišek: Vpliv kovin na protibakterijsko učinkovitost taninov
8. Zala Serianz: Iskanje novih zaviralcev, ki preprečujejo vezavo SARS-CoV-2 na neuropilin 1
9. Tjaša Skarlovnik: Meritve osmolarnosti izotoničnih napitkov za hidracijo telesa pri športni aktivnosti
10. Žan Smrekar: Študij vezave peptidov na Fc regije protiteles
11. Franjo Frešer: Koordinacijske spojine elagitaninov z železovimi(II) ioni: vpliv strukture in pH
12. Tamara Hribernik: Znotrajcelični antioksidativni potencial različnih sort hmelja
13. Matic Orel: Vibracijski in rotacijski prehodi enostavnih molekul
14. Katja Lečnik: Antigenotoksični potencial rožmarinskih ekstraktov
15. Alain Kerhe: Priprava tankoslojnih plasti na osnovi tio 2 v namene protikorozijske zaščite
16. Ajda Sušnik: Adhezija modelnih celic na kovinske elektrode za uporabo v biosenzoriki
17. Zala Štukovnik: Izdelava in optimizacija elektrokemijske celice za uporabo v biosenzoriki
18. Matic Broz: Vpliv polimorfizma posameznega nukleotida rs 4880 na genu sod2 na sekundarno strukturo encima manganove superoksid-dismutaze
19. Barbara Grabrovec: Interakcije biotehnološko relevantnih encimov
20. Mirna Pivac: Funkcionalizacija polietilenskih folij s biopolimeri za razvoj aktivne embalaže

BSc theses (52)

1. Luka Rozman: Raziskovanje antikarcinogenih učinkov polifenolov iz smilja kot inhibitorjev Pim-1 kinaze
2. Emilija Ristevska: In silico načrtovanje potencialnih peptidov, ki preprečujejo agregacijo biofarmacevtskih proteinov
3. Brin Hlade: Razvoj novih večvalentnih polifosfatnih pomožnih snovi za uporabo v formulaciji zdravil na osnovi proteinov
4. Lucija Novak: VPLIV METODE IN BAZNEGA SETA NA IZRAČUN SPEKTRA UV/VIS IN ECD
5. Aljaž Šparaš: Vpliv procesnih parametrov na biosintezo in razpad klavulanske kisline
6. Gašper Dimnik: Molekulska dinamika vezave cianidina na SIRT6: pomembnost za človeško zdravje
7. Nik Perko: Detekcija farmacevtskih učinkovin s celicami kvasovk vrste Saccharomyces cerevisiae nanešenimi na elektrokemijsko celico (biosenzor)
8. Matjaž Jalovec: Vpliv Ph na kinetiko oksidacije galne kisline
9. Maša Jagodič: Primerjava različnih vrst stekla za in situ karakterizacijo bioloških zdravil
10. Jan Vodenik: Ionske tekočine kot inhibitorji korozijskih procesov
11. Lara Jan Klinc: Izolacija ad-humulona in določitev vrednosti pKa
12. Aljoša Poš: Analiza glikoproteina (gp) virusa zaire ebolavirus ter identifikacija potencialnih terapevtskih tarč z orodji probis in cmdock
13. Tjaša Krepek: Določevanje vpliva multivalentnih fosfatnih in sulfonatnih pomožnih snovi na agregacijo proteinov za uporabo v biofarmacevtskih izdelkih
14. Tjaša Štiberc: Priprava zelenih hidrofobnih plasti z antikorozijskimi lastnostmi
15. Anja Zaverla: Preučevanje interakcij med tanini in lizocimom
16. Jaka Kodelja: Razvoj stacionarne faze za separacijo naravnih spojin
17. Alja Špec: Študija in optimizacija vezave antikalinov na male molekule
18. Lamija Ahmetović: Računalniško modeliranje antikarcinogenih učinkov naringenina
19. Tadeja Rožman: Priprava antikorozijske prevleke z enkapsuliranim inhibitorjem
20. Aljaž Knez: Analiza gruč kemijskega prostora protibakterijskih učinkovin
21. Benjamin Stradar: Načrtovanje pentapeptidov za vezavo na fc regijo protiteles
22. Marijana Krstić: Optical detection of stress parameters
23. Stela Tashkova: Optimization of conditions for enzymatic decomposition of fibrous cotton textile waste
24. Jan Čokolič: Eksperimentalna analiza vezave pomožnih snovi na zdravilno učinkovino
25. Eva Patik: Komercialna kurkuma kot inhibitor korozijskih procesov
26. Alen Kostevc: Adsorpcija poliakrilne kisline (PAA) na površino kalcijevega karbonata
27. Ajda Raj Miloševič: Tvorba koordinacijskih spojin galne kisline z bakrovimi in aluminijevimi ioni
28. Deniz Agačević: Študij deskriptorjev molekulske oblike protibakterijskih učinkovin
29. Simon Zadravec: Vpliv velikosti delcev kalcijevega karbonata na lastnosti papirja za inkjet
30. Matej Keber: Izolacija naravne spojine iz hmelja in določitev vrednosti pKa
31. David Tian Hren: Eksperimentalna raziskava rumenenja PVC
32. Tine Vidmar: Protibakterijske učinkovine hmelja
33. Urška Sušec: Identifikacija prevladujočih skeletov v protibakterijskih učinkovinah
34. Tina Dšuban: Med kot inhibitor korozijskih procesov
35. Ana Goričan: Ekstrakt šipka kot zeleni inhibitor korozijskih procesov
36. Jan Gimpelj: Identifikacija prevladujočih funkcionalnih skupin v protibakterijskih učinkovinah
37. Miha Fermišek: Tvorba koordinacijskih spojin med hidrolizirajočimi tanini in Fe(II)
38. Urška Vtič: Pinocembrin iz medu kot potencialni lovilec kemijskih karcinogenov - računalniški pristop
39. Ana Perpar: Tanin kot zaviralec korozije na jeklu
40. Nikolina Cetin: Optimizacija elektrokromnega traku z različnimi vrstami kovinskih oksidov
41. Anja Copot: Pametne prevleke za zaščito konstrukcijskih materialov
42. Staša Velcl: Analiza kemijskega prostora, ki ga zavzemajo protibakterijske učinkovine
43. Klara Laura Cokan: Kofein kot inhibitor korozijskih procesov v agresivnem mediju
44. Ines Masten: Detekcija ohranjenih vod na medproteinskih površinah
45. Matic Košir: Primerjava bioprocesov s celično linijo CHO v različnih bioreaktorjih
46. Franjo Frešer: Tvorba koordinacijskih spojin med osnovnimi gradniki taninov in Fe(II)
47. Simona Sedonja: Inhibicijska učinkovitost propolisa v namen zaščite konstrukcijskih materialov
48. Žan Smrekar: Računalniško načrtovanje terapevtskih proteinov
49. Špela Slapničar: Inhibicijska učinkovitost mešanice škroba in površinsko aktivnih snovi v kislem mediju
50. Rok Špendl: Inhibicijske lastnosti medu na jeklu v agresivnem mediju
51. Tibor Mlakar: Primerjava izračunanih in numeričnih rezultatov pri obravnavi molekule vodika
52. Vanja Mlinarič: Vpliv ionov Hofmeisterjeve vrste na premik kritične micelne koncentracije površinsko aktivnih snovi (ionskega tipa)

Other documents (59)

1. Mina Miličić, Veronika Furlan, Maša Knez Marevci, Urban Bren: Thymus vulgaris and Thymus serpyllum
2. Zala Štukovnik, Veno Kononenko, Matej Hočevar, Damjana Drobne, Urban Bren: Cytotoxicity assessment using label-free impedimetric biosensing
3. Tim Godec, Carissa Bleker, Katja Stare, Tjaša Lukan, Valentina Levak, Magda Tušek-Žnidarič, Tina Kosjek, Katarina Petra Van Midden, Marina Klemenčič, Kristina Sepčić, Maruša Kerenčič, Tina Eleršek, Urban Bren, Marko Jukič, Samo Lešnik, Anže Županič: Functional genomics screening in Chlamydomonas reinhardtii maps the genetic landscape of tolerance to paraquat and diuron
4. Franjo Frešer, Petri Tähtinen, Jelena Tošović, Urban Bren, Gregor Hostnik: Ellagitannins as Al(III) chelators
5. Zala Štukovnik, Nik Perko, Urban Bren: Rapid eukaryotic impedimetric biosensing of naproxen and isoniazid
6. Adela Avdičević, Samo Lešnik, Urban Bren, Luka Čavka: CDK4/6 inhibitors for breast cancer therapy—a review of clinical trials, structural and computational approaches
7. Veronika Furlan, Vid Ravnik, Urban Bren, Marko Jukič: Insights into molecular mechanisms of polyphenolic compounds from Helichrysum italicum by inverse molecular docking fingerprint approach
8. Muzafera Paljevac, Gašper Vrečer, Urban Bren, Peter Krajnc: Bio-based polyHIPEs from eugenol-derived methacrylates
9. Erzsébet Mernyák, Marija Gjorgoska, Maša Sinreih, Aljaž Kotnik, Zala Zanoškar, Ajda Godec, Marko Jukič, Urban Bren, Rebeka Ignácz, Kornél Szőri, Zoltán Kele, Attila Hunyadi, Tea Lanišnik-Rižner: Directed C–H activation of 13α-estrone
10. Laura Činč Ćurić, Gregor Hostnik, Klara Laura Cokan, Urban Bren, Marko Milojević, Matej Vesenjak, Polona Dobnik-Dubrovski, Nejc Novak, Uroš Maver, Tina Maver: P. lanceolata L. and P. major L. extracts in 3D-printed polysaccharide dressings for improved wound healing in vitro
11. Franjo Frešer, Gregor Hostnik, Urban Bren: Model for the description of interactions between ellagitannins and Fe(II) ions
12. Tjaša Skarlovnik, Andraž Lamut, Gregor Hostnik, Boris Gole, Urban Bren: Osmolality and tonicity of isotonic beverages
13. Tjaša Skarlovnik, Bojan Šarac, Urban Bren, Sabina Vohl, Gregor Hostnik: The influence of cohumulone on thermodynamics of micellization of alkyl trimethyl ammonium bromide surfactants
14. Andrej Milisavljević, Jure Pražnikar, Urban Bren, Marko Jukič: Cheminformatic analysis of protein surfaces provides binding site insights andinforms identification strategies
15. Anja Kolarič, Marko Jukič, Urban Bren: Machine learning in antiviral drug design
16. Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren: Unveiling polyphenol-protein interactions
17. Anja Kolarič, Marko Jukič, Urban Bren: Novel small-molecule inhibitors of the SARS-CoV-2 spike protein binding to neuropilin 1
18. Katarina Kores, Zala Kolenc, Veronika Furlan, Urban Bren: Inverse molecular docking elucidating the anticarcinogenic potential of the hop natural product xanthohumol and its metabolites
19. Samo Lešnik, Urban Bren: Mechanistic insights into biological activities of polyphenolic compounds from rosemary obtained by inverse molecular docking
20. Martin Rozman, Zala Štukovnik, Ajda Sušnik, Amirhossein Pakseresht, Matej Hočevar, Damjana Drobne, Urban Bren: A HepG2 cell-based biosensor that uses stainless steel electrodes for hepatotoxin detection
21. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Urban Bren: Commercial SARS-CoV-2 targeted, protease inhibitor focused and protein–protein interaction inhibitor focused molecular libraries for virtual screening and drug design
22. Anja Kolarič, Vid Ravnik, Sara Štumpf Horvat, Marko Jukič, Urban Bren: Identification of furin protease small-molecule inhibitor with a 1,3-thiazol-2-ylaminosulfonyl scaffold
23. Valeriia V. Sliesarenko, Marijana Krstić, Urban Bren, Aleksandra Lobnik: Development of fluorescence-based method for dopamine determination using o-phthaldialdehyde and 3-mercaptopropyltriethoxysilane
24. Katarina Kores, Samo Lešnik, Urban Bren: Computational analysis of S1PR1 SNPs reveals drug binding modes relevant to multiple sclerosis treatment
25. Aleksandra Pavičević, Marija Veles, Jelena P. Maksimović, Jelena Tošović, Urban Bren, Uroš Čakar, Maja C. Pagnacco: The Bray–Liebhafsky oscillatory reaction as a chemosensor for benzenediols
26. Jelena Tošović, Zala Kolenc, Gregor Hostnik, Urban Bren: Exploring antioxidative properties of xanthohumol and isoxanthohumol
27. Zala Štukovnik, Urban Bren: Recent developments in electrochemical-impedimetric biosensors for virus detection
28. Veronika Furlan, Jelena Tošović, Urban Bren: QM-CSA: a novel quantum mechanics-based protocol for evaluation of the carcinogen-scavenging activity of polyphenolic compounds
29. Anja Petek, Urban Bren, Gregor Hostnik: How deprotonation of cohumulone and colupulone influence their UV/Vis and CD spectrum
30. Steliana Tsouri, Evanthia Tselo, Georgios E. Premetis, Veronika Furlan, Panagiota D. Pantiora, Barbara Mavroidi, Dimitris Matiadis, Maria Pelecanou, Anastassios C. Papageorgiou, Urban Bren, Marina Sagnou, Nikolaos E. Labrou: A monocarbonyl curcuminoid derivative inhibits the activity of human glutathione transferase A4-4 and chemosensitizes glioblastoma cells to temozolomide
31. Franjo Frešer, Urban Bren, Gregor Hostnik: Chelation of iron(II) ions by ellagitannins - effects of hexahydroxydiphenoyl and nonahydroxytriphenoyl groups
32. Ahmed Sabt, Veronika Furlan, Urban Bren: Novel coumarin-6-sulfonamide-chalcone hybrids as glutathione transferase P1-1 inhibitors
33. Valeriia V. Sliesarenko, Urban Bren, Aleksandra Lobnik: Fluorescence based dopamine detection
34. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Urban Bren: Molecular Filters in Medicinal Chemistry
35. Zala Kolenc, Tomaž Langerholc, Gregor Hostnik, Miha Ocvirk, Sara Štumpf Horvat, Maša Kozmos, Iztok Jože Košir, Andreja Čerenak, Alenka Garmut, Urban Bren: Antimicrobial properties of different hop (Humulus lupulus) genotypes
36. Vid Ravnik, Marko Jukič, Urban Bren: Identifying Metal Binding Sites in Proteins Using Homologous Structures, the MADE Approach
37. Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren: Mechanistic insights of polyphenolic compounds from rosemary bound to their protein targets obtained by molecular dynamics simulations and free-energy calculations
38. Matic Broz, Chris Oostenbrink, Urban Bren: The effect of microwaves on protein structure: molecular dynamics approach
39. Jelena Tošović, Domagoj Fijan, Marko Jukič, Urban Bren: Conserved water networks identification for drug design using density clustering approaches on positional and orientational data
40. Zala Kolenc, Tamara Hribernik, Tomaž Langerholc, Maša Kozmos, Maja Prevolnik Povše, Urban Bren: Antioxidant activity of different hop (Humulus lupulus L.) genotypes
41. Veronika Furlan, Urban Bren: Helichrysum italicum
42. Panagiota D. Pantiora, Veronika Furlan, Dimitris Matiadis, Barbara Mavroidi, Fereniki Perperopoulou, Anastassios C. Papageorgiou, Marina Sagnou, Urban Bren, Maria Pelecanou, Nikolaos E. Labrou: Monocarbonyl Curcumin Analogues as Potent Inhibitors against Human Glutathione Transferase P1-1
43. Sara Štumpf Horvat, Gregor Hostnik, Tomaž Langerholc, Maša Kozmos, Zala Kolenc, Urban Bren: The Influence of Chestnut Extract and Its Components on Antibacterial Activity against Staphylococcus aureus
44. Zala Štukovnik, Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Nanomaterials and their recent applications in impedimetric biosensing
45. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Miha Bahun, Luka Krajnc, Anja Kolarič, Milan Hodošček, Nataša Poklar Ulrih, Urban Bren: Identification of triazolopyrimidinyl scaffold SARS-CoV-2 papain-like protease (PLpro) inhibitor
46. Marko Jukič, Sebastjan Kralj, Anja Kolarič, Urban Bren: Design of Tetra-Peptide Ligands of Antibody Fc Regions Using In Silico Combinatorial Library Screening
47. Matic Broz, Marko Jukič, Urban Bren: Naive prediction of protein backbone phi and psi dihedral angles using deep learning
48. Matic Broz, Anja Kolarič, Marko Jukič, Urban Bren: Neuropilin (NRPs) related pathological conditions and their modulators
49. Matic Broz, Veronika Furlan, Samo Lešnik, Marko Jukič, Urban Bren: The effect of the Ala16Val mutation on the secondary structure of the manganese superoxide dismutase mitochondrial targeting sequence
50. Sebastjan Kralj, Marko Jukič, Urban Bren: Comparative Analyses of Medicinal Chemistry and Cheminformatics Filters with Accessible Implementation in Konstanz Information Miner (KNIME)
51. Marko Jukič, Dušanka Janežič, Urban Bren: Ensemble Docking Coupled to Linear Interaction Energy Calculations for Identification of Coronavirus Main Protease (3CLpro) Non-Covalent Small-Molecule Inhibitors
52. Urban Bren: Zbirka rešenih nalog iz Fizikalne kemije I
53. Lidija Fras Zemljič, Damjan Tomažin, Urban Bren, Maša Knez Marevci, Larisa Spasković, Uroš Filipič, Katja Kuzmič, Klavdija Petelin, Martina Švajger, Rok Špindler, Stanko Kramer, Katja Lečnik: Razvoj aktivne plastične embalaže
54. Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Pojavi na površinah
55. Regina Fuchs-Godec, Urban Bren: Laboratory manual for thermodynamics
56. Tomaž Mohorič, Urban Bren, Vojko Vlachy: Effects of translational and rotational degrees of freedom on the hydration of ionic solutes as seen by the popular water models
57. Nataša Logar Berginc, Katja Benevol Gabrijelčič, Urban Bren, Sašo Dolenc, Katarina Krapež, Miro Romih, Mojca Žagar Karer, Simon Krek, Vojko Gorjanc, Mateja Jemec Tomazin, Špela Arhar Holdt, Darja Fišer: Terminologija v poklicnem vsakdanu
58. Mitja Ogrizek, Janez Konc, Urban Bren, Milan Hodošček, Dušanka Janežič: Role of magnesium ions in the reaction mechanism at the interface between Tm1631 protein and its DNA ligand
59. Eva Brglez Mojzer, Maša Knez Marevci, Mojca Škerget, Željko Knez, Urban Bren: Polyphenols: extraction methods, antioxidative action, bioavailability and anticarcinogenic effects